Modelling human immune response dynamics to Mycobacterium Tuberculosis infection.
Date
2017-12
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Stellenbosch : Stellenbosch University
Abstract
ENGLISH SUMMARY: Tuberculosis (TB), caused by Mycobacterium tuberculosis (MTB) still poses a great challenge
to the well-being of the population, particularly in Sub-Saharan Africa. The ability
to trigger strong mounted cellular response within the host environment is daunting.
The host cell depends on the robust adaptive cellular immunity to battle MTB infection.
Of these, localizing TB bacteria by the development and the sustainability of a strong
T helper type 0 cells (Th0) response is key to thwart MTB dissemination. The factors
fuelling TB pathogenesis include, Human Immunodeficiency Virus (HIV) and TB copandemic,
the growing burden of Multidrug-resistant TB (MDR-TB) and Extensive drug
resistant TB (XDR-TB), and incompetency of host cell to kill MTB. The survived MTB
load can trigger Latent TB infection (LTBI). In addition, the largely unknown biology
of the host-MTB interaction, is yet to be elucidated. In this study, we develop a mathematical
model capturing and addressing key dynamics of the adaptive host immune
response to MTB infection. Of these, we consider the interplay of MTB with three distinct
subsets of key immune cells and cell signalling molecules, namely; macrophages,
T cells and cytokines. Furthermore, we explore the mechanisms of phagocytosis, T cells
priming with delay, macrophage activation leading to lysis of infected cells. To estimate
unknown parameters in the model, we perform curve fitting to experimental data of an
infected mice using non-linear least square and Bayesian-based Markov Chain Monte Carlo methods. We use the reproductive number R0, to address factors altering the stability
of the system. This study provides insight on how the immune system can be
amplified to clear the survived intracellular MTB.
AFRIKAANSE OPSOMMING: Tuberkulose (TB), wat veroorsaak word deur Mycobacterium tuberculosis (MTB), bied steeds ’n groot uitdaging tot die welvaart van die bevolking, spesifiek in Sub-Sahara Afrika. Die vermoë om ’n sterk gemonteerde sellulêre reaksie in die gasheeromgewing te wek is ontmoedigend. Die gasheersel is afhanklik van die robuuste aanpasbare sellulêre immuniteit om MTB infeksie teen te veg. Van hierdie, is die lokalisering van TB bakterië deur die ontwikkeling en volhoubaarheid van sterk T helper tipe 0 selle (Th0) reaksie die sleutel om MTB verspreiding te stuit. Die faktore wat TB patogene aanhelp sluit in ’n Menslike Immuniteitsgebreksvirus (MIV) en TB mede-pandemie, die groeiende las van multidwelmbestande TB (MDR-TB) en uitgebreide dwelmbestande TB (XDR-TB), en die onvermoë van die gasheersel om MTB dood te maak. Die oorlewende MTB lading kan lei tot ’n latente TB infeksie (LTBI). Daarbenewens moet die grootliks onbekende biologie van die gasheer-MTB interaksie nog toegelig word. In hierdie studie ontwikkel ons ’n wiskundige model wat die sleuteldinamika van die aanpasbare gasheerimmuunreaksie tot MTB infeskie opvang en aanspreek. Uit hierdie beskou ons die interspel van MTB met drie verskillende deelversamelings van sleutel immuunselle en selseiningsmolekules, naamlik: makrofage, T selle en sitokiene. Verder verken ons die meganismes van fagositose, T-sel primering met vertraging, makrofage aktivering wat lei tot lise in besmette selle. Om onbekende parameters in die model te benader, pas ons ’n kurwepassing toe op eksperimentele data van besmette muise en gebruik nie-lineêre kleinste kwadrate en Bayesies-gebaseerde Markov-ketting Monte Carlo metodes, onderskeidelik. Ons gebruik die voortplantingsgetal R0 om die faktore wat die stabiliteit van die stelsel verander, aan te spreek. Hierdie studie gee insig oor hoe die immuunstelsel versterk kan word om die oorblywende intrasellulêre MTB te verwyder.
AFRIKAANSE OPSOMMING: Tuberkulose (TB), wat veroorsaak word deur Mycobacterium tuberculosis (MTB), bied steeds ’n groot uitdaging tot die welvaart van die bevolking, spesifiek in Sub-Sahara Afrika. Die vermoë om ’n sterk gemonteerde sellulêre reaksie in die gasheeromgewing te wek is ontmoedigend. Die gasheersel is afhanklik van die robuuste aanpasbare sellulêre immuniteit om MTB infeksie teen te veg. Van hierdie, is die lokalisering van TB bakterië deur die ontwikkeling en volhoubaarheid van sterk T helper tipe 0 selle (Th0) reaksie die sleutel om MTB verspreiding te stuit. Die faktore wat TB patogene aanhelp sluit in ’n Menslike Immuniteitsgebreksvirus (MIV) en TB mede-pandemie, die groeiende las van multidwelmbestande TB (MDR-TB) en uitgebreide dwelmbestande TB (XDR-TB), en die onvermoë van die gasheersel om MTB dood te maak. Die oorlewende MTB lading kan lei tot ’n latente TB infeksie (LTBI). Daarbenewens moet die grootliks onbekende biologie van die gasheer-MTB interaksie nog toegelig word. In hierdie studie ontwikkel ons ’n wiskundige model wat die sleuteldinamika van die aanpasbare gasheerimmuunreaksie tot MTB infeskie opvang en aanspreek. Uit hierdie beskou ons die interspel van MTB met drie verskillende deelversamelings van sleutel immuunselle en selseiningsmolekules, naamlik: makrofage, T selle en sitokiene. Verder verken ons die meganismes van fagositose, T-sel primering met vertraging, makrofage aktivering wat lei tot lise in besmette selle. Om onbekende parameters in die model te benader, pas ons ’n kurwepassing toe op eksperimentele data van besmette muise en gebruik nie-lineêre kleinste kwadrate en Bayesies-gebaseerde Markov-ketting Monte Carlo metodes, onderskeidelik. Ons gebruik die voortplantingsgetal R0 om die faktore wat die stabiliteit van die stelsel verander, aan te spreek. Hierdie studie gee insig oor hoe die immuunstelsel versterk kan word om die oorblywende intrasellulêre MTB te verwyder.
Description
Thesis (MSc)--Stellenbosch University, 2017.
Keywords
Mycobacterium tuberculosis, Immune response -- Mathematical models, Macrophagus, Cytokines, T cells, Non-linear least square, Bayesian statististical decision theory, Markov processes, Monte Carlo method